在锅炉的运行中，一旦发生如下几种情形之一，FESS就会进行紧急停炉，也就是主燃料的跳闸处理;全炉膛灭火，炉膛压力超过上限或者低于下限，送风中断产生的跳闸，引风与燃料中断，炉内水位异常等。这些现象刚刚发生的时候一般不易被人们察觉，而一旦察觉到了，就可能已经造成了严重的后果。所以应用FESS，可以避免这类问题的产生。
在电站锅炉启用之前和发生事故停用之后，都要对炉内进行吹扫，目的是为了将炉膛内与烟道内的爆炸性混合物清理干净，以免在点火的时候发生爆炸而引发危险。进行吹扫的时候需要满足以下条件：送风机与引风机正常运行，水位正常，燃料撤除，跳闸复位。
而这些条件如果人为的进行检查，很难做到面面俱到，如果一不小心产生疏漏，那么后果会很严重。所以FESS可以很好的解决这些困扰，它运用计算机进行自主检测，然后进行吹扫作业，即简便，又安全。
锅炉安全保护系统会在电站锅炉运行的过程中进行全程监控，对发生的一些不安全现象及时发出警报，比如炉内燃料燃烧不稳，炉膛内的压力不符合规定限制，炉内接点出现技术故障等，它都会一一监测到，然后发出报警信号，促使技术工作人员及时进行检修，以保证电站锅炉的正常运行。
